El Instituto de Ecología es entidad académica participante en los posgrados en Ciencias Biomédicas y en Ciencias Biológicas, ambos programas adecuados al Reglamento General de Estudios de Posgrado de 1995 y tiene bajo su responsabilidad la Maestría en Restauración Ecológica. Actualmente posee un número de estudiantes considerable: más de 200 estudiantes de posgrado y 100 de licenciatura.