CURRICULUM VITAE

Valeria Francisca Eugenia Leopoldina de María de Guadalupe Souza Saldivar

Abril 2001

 

 

1. Datos generales

 1.1 Lugar de nacimiento: México D.F

 1.2 Nacionalidad: Mexicana

 1.3 Registro federal de contribuyentes: SOSV580428

 1.4 Domicilio:Mirador 63 casa 23A, Fuentes de Tepepan, Tlalpán, 14620. México DF.

       Telefonos 622 9006 of

                        555 3360 casa

2. Formación académica

2.1 Estudios profesionales.  

 

Licenciatura:

      Lugar: Facultad de Ciencias , UNAM.

          Periodo de estudios: 1979-1983

    Grado obtenido: Bióloga

          Promedio: 9.7

Tesis profesional: Inducción de intercambios de cromátidas hermanas por alcohol furfurílico  y furfural en linfocitos humanos, un estudio in vivo e in vitro. 

 

2.2 Estudios de posgrado.

 

Maestría

  Lugar: Facultad de Ciencias , UNAM.

          Periodo de estudios: 1983-1985.

    Grado obtenido: Maestría en Ciencias (Biología)

          Promedio: 9.7

Tesis profesional: Inducción de intercambios de cromátidas hermanas en cultivo de linfocitos  humanos por diversos compuestos de níquel y su relevancia en la carcinogénesis.

 

Doctorado

  Lugar: Centro de Ecología , UNAM.

          Periodo de estudios: 1985-1990.

    Grado obtenido: Doctor en Ecología

          Promedio: 9.7

Tesis profesional: Genética y ecología de poblaciones de Rhizobium leguminosarum biovar  phaseoli asociado a Phaseolus vulgaris y a P. coccineus cultivado y silvestre, en Morelos,  México.

 

3. Experiencia.

 

3.2. Investigación

1) Estancia postdoctoral en el Departamento de Ecology and Evolutionary Biology, University of California in Irvine, USA.Laboratorio del Dr. R. Lenski, de Septiembre 1990 hasta julio 1992.

 

2) Estancia postdoctoral en el Center for Microbial Ecology. Michigan State University. USA.

En el laboratorio del Dr. R. Lensky de agosto 1992 hasta febrero 1993.

 

3) Investigador Asociado C de Tiempo Completo Centro de Ecología UNAM, Departamento de Ecología Evolutiva.Laboratorio de Evolución molecular y experimental de de mayo 1993 a 1997.

 

4) Investigador Titular A de Tiempo Completo Instituto de Ecología UNAM, Departamento de Ecología Evolutiva.Laboratorio de Evolución molecular y experimental de desde  mayo 1997.

 

3.3 Docencia

Escuela Nacional de Antropología e Historia

1) Ayudante de profesor de Genética y Bioquímica, primer y segundo semestre 1982.

2) Profesor de Bioquímica, primer semestre 1983

 

Facultad de Ciencias, UNAM

3) Ayudante de profesor en biología de campo sobre Citogenética Vegetal como sistema de prueba biológico. Primer y segundo semestre 1983.

 

4) Profesor de biología de campo sobre Citogenética Vegetal como sistema de prueba biológico, de 1984 a 1986.

 

5) Profesor de biología de campo sobre Genetica de Poblaciones Bacterianas de 1986 a 1988.

 

6) Profesor de Sistemática Molecular en el segundo semestre 1994

Diplomado en biología comparada contemporanea, CONABIO-Fac.  de Ciencias, UNAM.

 

7) Profesor de Genetica Evolutiva segundo semestre 1995 Centro de Ecología-Fac.  de Ciencias, UNAM.

 

8) Profesor titular de Biología de Procariontes de 1996 a la fecha.

 

9) Coordinadora de Biología de Procariontes. desde febrero 1997 a la fecha, Fac. de Ciencias, UNAM.

 

Escuela Nacional de Salud Pública

10) Profesor of Ecología, primer semestre 1988.

 

Centro de Ecología, UNAM

11) Profesor de "Seminario sobre genética de poblaciones y técnicas electroforéticas aplicadas a insectos sociales" verano 1990.

 

12) Profesor de Evolución Molecular en el primer semestre 1994, Posgrado de Ecología UACPyP, del CCH.

 

13) Profesor de Genética Evolutiva desde el segundo semestre 1995 hasta la fecha, Posgrado de Ecología UACPyP, del CCH

 

4.-Cargos honoríficos

 

5. Distinciones académicas y becas.

 

5.1. Distinciones.

1) Fellowship de la fundación MacArthur de julio 1994 hasta junio 1997.

 

2) Nominada por la Facultad de Medicina, UNAM para el International Research Scholars Program of the Howard Hughes Medical Institute" para el proyecto de Evolución de la patogénesis en Escherichia coli.

 

3) Nivel de PRIDE c de 1997 a la fecha

 

4) Miembro del sistema nacional de investigadores desde junio 1990, (candidato SNI) y miembro del nivel uno desde julio 1996.

 

5.2 Revisión de proyectos

1995 Revisión de proyectos de CONACyT

1996 Revisión de proyectos de CONACyT

1997 Revisión de proyectos de CONACyT

1998 Revisión de proyectos de la NSF, USA

2000 Revisión de proyectos de CONACyT.

 

5.3 Revisión de manuscritos

Revistas internacionales

1996 Dos manuscritos revisados para Molecular Ecology

1996 Manuscrito revisado para Evolution

1997 Manuscrito revisado para Proceedings of the National Academy of Sciences USA

2000 Manuscrito revisado para Proceedings of the National Academy of Sciences USA\

         Dos Manuscritos revisados para FEMS microbiology.

         MAnuscrito revisado para Molecular Ecology

 

5.4 Becas

1) Becaria de postgrado de la UNAM, DGAPA para obtener el grado de Maestría 1983-1985.

    

2) Becaria de postgrado de CONACyT para obtener el grado de doctorado 1985-1987.

 

3) Becaria de postgrado de la UNAM, DGAPA para obtener el grado de Doctorado 1987-1990.

 

4) Becaria de postdoctorado de la UNAM, DGAPA para una estancia de dos años en el Dep. of Ecology and Evolutionary Biology, University of California in Irvine. USA

 

5) Becaria para estancia sabatica por parte de DGAPA y CONACyT

 

5.4.2 Proyectos y financiamiento

Responsable de proyecto

1) Mujeres campesinas y frijol financiado por la Fundación MacArthur, programa de población y ambiente con 75,000 USD por tres años

 

2) Efecto de las cepas de Rhizobium etli en la productividad del frijol en Mèxico. Fertilizantes Fluidos SA de CV. V.desde marzo 1998 con V. Souza como responsable y con un gasto de 471,000 pesos por dos años.

 

3) Proyecto:Análisis filogenético de Escherichia coli y Helicobacter pylori para el diseño de marcadores epidemiológicos y diseño de vacunas. Financiado por CONACyT desde noviembre 1998 hasta 2001 con V. Souza como responsable y con un gasto de 896,288 pesos por tres años.

 

4) Evolucion de la patogenesis en Escherichia  coli y Helicobacter pylori: un estudio comparativo. Financiado por DGAPA desde noviembre 1998 hasta 2001 con V. Souza como responsable y con un gasto de 709,311 pesos por tres años.

 

5) Evolution in microbe-based ecosystems: Desert springs as analoges for early development and stabilization of ecologycal systems. Financiado por NASA (USA) en colaboración con la Universidad estatal de Arizona, desde julio 2000 hasta julio 2003 con V. S. de responsable por parte de la UNAM y con un gasto de 82,000 dolares

 

Cooresponsable en los siguientes proyectos:

1) Evolución y Adaptación de Escherichia coli a vertebrados silvestres. Conacyt, aprobado el 13 de mayo 1994, con el Dr. Luis Eguiarte como responsable. Con un gasto aprobado de 288,607 pesos por dos años.

 

2) Diversidad genética en plásmidos de Escherichia coli y su papel en la evolución y adaptación bacteriana. DGAPA 1995 con el Dr. Alejandro Cravioto como responsable. Con un gasto aprobado de 480, 544 pesos por tres años.

 

3) Ecología conductual de reproduccion y de alimentación del murciélago zapotero (Artibeus jamaisesis) en yucatan. DGAPA 1995 con el Dr. Hector Arita como responsable. Con un gasto aprobado de 248,544 pesos por dos años.

 

 

6. Sociedades Científicas

1) Society for the Study of Molecular Evolution

2) American Society for Microbiology

3) American Association fot the Advancement of Science

4) The Genetics Society of America

 

7. Producción científica (120 citas)

 

7.1 Artículos de investigación en revistas arbitradas internacionales.  

1.-Gomez‑Arroyo S. and V. Souza (1985) In vitro occupational induction of sister chromatid exchanges in human lymphocytes with  furfural and furfurilic alcohol. Mutation Research, 156, 233‑238.

 

2.-Souza, V. and M. Puig (1987) Cytogenetic study in a group of workers exposed to thinner. Mutation Research, 189, 357‑362. (3 citas)

 

3.-Souza, V., T. T. Nguyen, D. Hudson, D. Piñero and R. E. Lenski (1992). Hierarchical analysis of linkage disequilibrium in Rhizobium populations: Evidence for sex?. Proceedings of the National Academy of Science USA, 89, 8389-8393.(64 citas)

 

4.-Souza, V., L.E. Eguiarte, G. Avila, C. Gallardo, R. Capello, J. Montoya and D. Piñero (1994). Genetic structure of Rhizobium associated with wild and cultivated beans.Applied and Environmental Microbiology. 60, 1260-1268.(26 citas)

 

5.-Lenski, R., V. Souza, L. P. Duong, Q. G. Phan, Thrinh, N. M. Nguyen, and K. P. Beltran (1994). Epistatic effects of promoter and repressor funtions of the Tn10 tetracycline resistance operon on the fitness of Escherichia coli K12. Molecular Ecology 3, 127-135.(10 citas)

 

6.-Turner, P., V. Souza y R. Lenski (1996) Test of ecological mechanisms promoting the stable coexistence of recombinant bacterial genotypes. Ecology 77: 2119-2129.(13 citas)

 

7.-Souza, V., P. Turner and R. Lenski. (1997) Long-term experimental  evolution in Escherichia coli IV: effects of recombination with exogenous genotypes on evolutionary dynamics. Journal of Evolutionary Biology 10: 743-769. (10 citas)

 

8.-Souza, V., J. Bain, C. Silva, V. Bouchet, E. Márquez y L. Eguiarte (1997).  Etnomicrobiology: do agricultural practices modify the population structure of the nitrogen fixing bacteria Rhizobium etli? Journal of Etnobiology. 17: 249-266.  (3 citas)

 

9.- Souza, V., and L. Eguiarte (1997) Bacteria gone native vs. bacteria gone awry?: Plasmidic transfer and bacterial evolution. Proceedings of the National Academy of Science USA, 94: 5501-5503. (8 citas)

 

10.-  L. Eguiarte, V. Souza, J. Núñez-Farfán y B. Hernández-Baños (1997). El anàlisis filogenètico: Mètodos, problemas y perspectivas. Boletín de la Sociedad Botánica de México. 60: 169-181.

 

11.- L. E. Eguiarte, V. Souza, J. Núñez-Farfán (1998) La revoluciòn Darwiniana y la evolución molecular. TIP Revista especializada en Ciencias Quìmico Biològicas, UNAM, Facultad de Estudios superiores Zaragoza. 1: 8-16.

 

12.- García-Franco, J. G., V. Souza, L. E. Eguiarte and V. Rico- Gray (1998) Population genetics of the tropical holoparasitic   endophyte Bdallophyton bambusarum. Plant systematics and Evolution.210: 271-288.

 

13.- C. Silva, L. Eguiarte and V. Souza. (1999) Spatial analysis of Rhizobium etli biovar phaseoli in a traditionally mananged locality in Mexico. Molecular Ecology 8: 277-288. (3 citas)

 

14.- Souza, V. M. Rocha, A. Valera and L.E.  Eguiarte (1999) Genetic structure of natural populations of  Escherichia coli in wild hosts on different continents. Applied and Environmental Microbiology 65: 3373-3385 (6 citas)

 

15.- Souza, V. M. Rocha, A. Valera and L.E.  Eguiarte (2000) Letter to the editor concerning the publication "Genetic structure of natural populations of  Escherichia coli in wild hosts on different continents." Applied and Environmental Microbiology.

 

16. L. E. Eguiarte, V. Souza A. Silva-Montellano (2000) Evolución de la familia Agavaceae: filogenia, Biología reproductiva y genética de poblaciones. bol. Soc. Bot. México. 66: 131-150.

 

17.- .Peek A. S., V. Souza, L. E. Eguiarte and B. S. Gaut  (2001) Selection and recombination at the type 1-fimbrial major subunit (fimA) in natural isolates of Escherichia coli. Journal of Molecular Evolution. 52: 193-204.

 

18.-Solís-Guzmán G., J. Ramírez-Santos, V. Souza and M. C. Gómez-Eichelmann Analysis of the regulatory region of gene rpoH of Escherichia coli strains isolated from different non-human hosts. Aceptado con correciones en Applied and Environmental Microbiology. correciones enviadas en marzo, 2001

 

19.- Peek, A. S. V. Souza L. E. Eguiarte and B. Gaut. Genetic variation, selection and recombination at the gapA, mdh and PutP loci in non-ECOR natural isolates of Escherichia coli. Enviado a Microbiology en noviembre, 2000

 

20.-Sandner, L., L. Eguiarte, A. Navarro, O. Rodríguez, A. Cravioto and V. Souza. An analysis of the elements of the locus of enterocyte effacement in human and wild mammal isolates of Escherichia coli: evolution by assemblage or deconstruction? Enviado a Microbiology en noviembre, 2000.

 

21.-C. Silva, L.E. Eguiarte, E. Martínez-Romero, V. Souza, Temporal chromosomal and plasmidic population genetic structure of Rhizobium etli bv. phaseoli. Enviado a Molecular Ecology en marzo, 2001

 

22.-V. Souza, A. Castillo, L. Sandner, M. Rocha, A. Valera, A. Cruz, R. Cerritos, C. Silva, E. Mancera y L. E. Eguiarte.  Ecología evolutiva de Escherichia coli. Articulo solicitado por invitación para Interciencia, Enviado en marzo, 2001

23.-P. Maravilla, V. Souza, A. Valera, Y. López-Vidal, J. Ambrosio and A. Flisser. .Genetic variation in Taenia solium analyzed by isozymes and RAPDS. Enviado a Parasitology en marzo, 2001

 

7.2 Capítulos en libros.

1.-Eguiarte, L. E., y V. Souza (1993). Evolución experimental en bacterias: Diez mil generaciones del experimento de Irvine, California. Tópicos de Biología Evolutiva. J. Nuñez-Farfán and C. Cordero (eds.) Centro de Ecología UNAM. Mexico DF.pp 129-153.

 

2.- Souza, V.  y L. Eguiate (2000) Evolución experimental en bacterias: Objetivos y Perspectivas. Tópicos de Biología Evolutiva II. J. Nuñez-Farfán y  J. C. Zamora (eds.) Co-edición Centro de Ecología UNAM. Mexico DF.

 

3.- Valeria Souza, Martha Rocha, Luisa Sander y Luis E. Eguiarte (en prensa) Historia natural, ecología y evolución de la patogenicidad en Escherichia coli. Libro virtual editado por UNAM.

 

7.4 Trabajos no arbitrados y memorias de congresos.

1984

1.-Gomez‑Arroyo, S. y V. Souza Inducción de ICH en linfocitos humanos por alcohol furfurílico y furfural in vitro e in vivo. IX Congreso Nacional de Genética Humana, Zacatecas.

 

1985

2.-Souza,V.,M. Puig y S. Gomez‑Arroyo. Monitoreo genético de una población ocupacionalmente expuesta a solventes. III Simposio Anual de ciencias y sistemas biológicos, UNAM.

3.-Puig, M., V. Souza y S. Gomez‑Arroyo. ICH provocados por tiner en linfocitos humanos en cultivo y en poblaciones ocupacionalmente expuestas.  III Simposio Anual de ciencias y sistemas biológicos, UNAM.

4.-Eguiarte, L., A. Búrquez, C. Martínez del Rio, H. Arita y V. Souza. Estudios de plantas polinizadas por murciélagos. III Simposio Anual de ciencias y sistemas biológicos, UNAM.

5.-Eguiarte, L., A. Búrquez y V. Souza. Pollination and reproductive biology of Manfreda brachystachia (Cav.) Rose. 36th Annual AIBS Meeting,Gainesville  Florida.

6.-Souza, V. y S. Gomez‑Arroyo. Inducción de ICH por  diversos com­puestos de níquel en cultivo de linfocitos humanos y su relevan­cia en la carcinogénesis. X Congreso Nacional de Genética Humana, Oaxaca.

7.-Puig, M., S. Gomez‑Arroyo, V. Souza y M. Reyes.  Efecto citogenético del tiner y el Ad‑Acryl en poblaciones ocupacionalmente expuestas. X Congreso Nacional de Genética Humana, Oaxaca.

 

1987

8.-Souza, V., L. Eguiarte,E. Solis, y M.Cevallos. Leguminosas y Rhizobiaceae:Estudio de poblaciones  naturales en Chamela Jalisco. X Congreso de Botaníca, Guadalajara.

9.-Lopez‑Portillo, J., y V. Souza. Variación en la  abundancia de estomas y glándulas de tres especies de  mangles en un gradiente salino de la Laguna de  Sontecomapan, Veracruz. X Congreso de Botaníca, Guadalajara. Octubre 1987

 

1988

10.- Piñero, D., A. Valdéz, V. Souza, R. Selander, R.  Palacios y E. Martínez. Population genetic structure in Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli: evolutionary   and biotechnological consecuences. IV International Symposium on Molecular Genetics of Plant‑Microbe Interactions, Acapulco. Junio 1988

 

1990

11.-Avila, G., C. Martínez, R. Capello y V. Souza. Genética de poblaciones y ecología de Rhizobium  leguminosarum biovar phaseoli asociado al frijol  ayocote Phaseolus coccineus en Morelos. XI Congreso de Botánica Morelos. Octubre 1990

 

1991

12.-Turner,P., V. Souza y R. Lenski. Fitness effects due to recombination in otherwise clonal populations of bacteria. Annual Meeting of the Society for the Study of Evolution. Hawaii. Julio 1991

13.-Souza, V., T. Nguyen, D. Hudson, D. Piñero and  R. Lenski. A hierarchical analysis of linkage disequilibrium in Rhizobium associated with bean plants.  The Gordon Conference on Population Biology and Evolution of Microorganisms. New Hampshire Julio 1991.

14.-Souza, V., P. Turner and R. Lenski. Paradoxical fitness  effects due to recombination in bacteria. Reunión anual   del California population genetics (CALPEG). San Francisco Diciembre 1991.

 

1992

15.-Souza, V., P. Turner and R. Lenski. Long-term experimental evolution in Escherichia coli: effects of recombination with exogenous genotypes on evolutionary  dynamics. II Forum of the Center for Microbial Ecology. E. Lansing Octubre 1991.

 

1993

16.-Souza, V., P. Turner and R. Lenski.  Effects of recombination with exogenous genotypes on evolutionary dynamics in a long-term experimental evolution in Escherichia coli: The Gordon Conference on Population Biology and Evolution of Microorganisms. New Hampshire. julio 1993

 

1994.

17.- Souza, V., L. Eguiarte, P. Turner and R. Lenski.  Genetic analysis of recombination with exogenous genotypes in  a long-term experiment in Escherichia coli The Evolution  Meeting, Athens, Georgia junio 1994

 

1995

18.-Souza, V., Claudia Silva, V. Bouchet, E. Márquez y L.  Eguiarte. Rhizobium etli in three localities of central   Mexico: Is the population structure influenced by the   agricultural practices? Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 

19.-Souza V., M. Rocha y L. Eguiarte. Escherichia coli is more variable and less clonal than what we thought. Evidence from a large collection of wild mammals.Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1995.

20.-Souza V. C. Silva, V. Bouchet y E. Márquez. Estructura  genética de Rhizobium etli y de su planta hospedera Phaseolus  vulgaris y P. coccineus en dos comunidades en Puebla. XIII  Congreso Mexicano de Botánica, Morelos. Mex. noviembre 1995.

 

1996

21.-Souza V. Sandner L. Rocha, M. y Eguiarte, L. The genetic  structure of wild E. coli and the evolution of pathogenicity. I  International Workshop on molecular epidemiology and  evolutionary genetics of pathogenic microorganisms. Atlanta,  Georgia. junio, 1996.

22.- Souza V. Gordon D. Sandner L. Rocha, M. y Eguiarte, L. The  genetic structure of wild E. coli at the chromosomal and plasmidic level. Annual meeting of The Society for the Study  of Evolution. St. Louis, Missouri. junio, 1996.

 

1997

23.- Valeria Souza, Luisa Sandner, Luis Eguiarte, Martha Rocha, Armando Navarro, and Alejandro Cravioto. The pathogenic genes eaeA and espB evolve independently from the Lee locus in Escherichia coli from wild mammals and humans. International Workshop on molecular epidemiology and  evolutionary genetics of pathogenic microorganisms. Montpellier, Francia. Mayo 1997.

24.- Souza V., M. Rocha y L. Eguiarte Linkage disequilibrium and effective population size in natural populations of Escherichia coli from wild mammals.Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1997.

25.- Luisa Sandner, L. Eguiarte Luis Eguiarte, Armando Navarro, and Alejandro Cravioto. Evolution of pathogenicity and antibiotic resistance in E. coli from wild mammals. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1997

26.- Claudia Silva, Valeria Souza and Aldo Valera. Spatial genetic structure of R. etli  associated to indigenous culivars of the common bean. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1997.

 

1998

27.- C. Silva, L. Eguiarte and V. Souza. Spatial analysis of Rhizobium etli biovar phaseoli in a traditionally mananged locality in Mexico. 16th North American Conference on Symbiotic Nitrogen Fixation. Cancún, Mèxico 1-6 febrero 1998.

28.- A. Valera V Bouchet and V. Souza Genetic and temporal structure of Rhizobium etli associated with cultivated beans in Calpan, Puebla. 16th North American Conference on Symbiotic Nitrogen Fixation. Cancún, Mèxico 1-6 febrero 1998.

29.- V. Souza, C. Silva, A. Valera V Bouchet and L. Eguiarte. Ethnomicrobiology: do agricultural practices modify the population structure of the nitrogen fixing bacteria Rhizobium etli?. 16th North American Conference on Symbiotic Nitrogen Fixation. Cancún, Mèxico 1-6 febrero 1998.

30.-Maravilla, J. Valera A. Souza V. and Flisser A.  Preliminary study of Taenia solium isoenzymatic patterns. International symposium on environmental adaptation of Echinococcus. Hokkaido, Japon 18-20 de Agosto 1998.

31. V. Souza, A. Valera, C. Silva. Mejoramiento de la bacteria fijadora de nitrógeno Rhizobium etli: Estrategias basadas en la genética de poblaciones. Simposio de transgénicos VII Congreso Latinoamericano de Botánica, Mexico DF 20 de octubre, 1998.

32 C. Silva, A. Valera y V. Souza. La estructura espacio temporal de Rhizobium etli  en San Miguel Acuexcomac, Puebla. V Congreso nacional de la sociedad de fijación biológica de nitrógeno. Cuernavaca, morelos del 25 al 27 de noviembre 1998.

33. V. Souza, A. Valera, V. Bouchet, C. Silva. La estructura genetica de Rhizobium etli y la agricultura. V Congreso nacional de la sociedad de fijación biológica de nitrógeno. Cuernavaca, morelos del 25 al 27 de noviembre 1998.

34. Maravilla, J. Valera A. Souza V. and Flisser A Estudio preliminar de electroforesis de isoenzimas en Taenia solium. XIII Congreso Nacional de Parasitología CONAPAR 98. Zacatecas del 8 al 10 de octubre, 1998.

 

1999

35. Peek, A. S. V. Souza L. E. Eguiarte and B. Gaut. Genetic variation, selection and recombination at the fimA, gapA, mdh and PutP loci in non-ECOR natural isolates of Escherichia coli. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

36. Bouchet V. V. Souza, R. Z. Jiang, L. E. Eguiarte, J. Geisselsoder, A. Cravioto and R. Goldstein. where do the pathogens fit into Escherichia coli population structure? Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

37.Sandner, L. . V. Souza, A. Navarro, A. Cravioto and L. E. Eguiarte. Evolution of the pathogenic locus LEE in Escherichia coli asociated to wild mammals and humans. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

38. R. Ceritos, V. Souza  and L. E. Eguiarte. Hierarchical genetic structure of natural populations of Escherichia coli in Mexican bats. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

39.V. Souza, Rocha M. A. Navarro, A. Cravioto and L. E. Eguiarte. Evolution of the pathogenic plasmid EAF: Horizontal transfer in Escherichia coli asociated from wild mammals and humans. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

40. C. Silva, L. E. Eguiarte and V. Souza. Plasmidic and Chromosomal dynamics of a Rhizobium etli local population. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

41. C. Silva, A. Valera, V. Bouchet, and L. E. Eguiarte The temporal and spatial genetic structure of Rhizobium etli bv phaseoli in two contrasting agricultural systems. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hampshire julio 1999.

 

2001

42. V. Souza, L. Sandner, A. Castillo y L. E. Eguiarte. Evolution of a pathogenic island in Escherichia coli. International symposium: Rhizobium etli genome project. Cuernavaca, Mor. 28 febrero a 2 de Marzo, 2001.

 

43. L. E. Eguiarte, A. Castillo y V. Souza. Molecular evolution in plants: the case of Agavaceae.  International symposium: Rhizobium etli genome project. Cuernavaca, Mor. 28 febrero a 2 de Marzo, 2001

 

 

7.5 Conferencias Internacionales (por invitación)

1994

1.-Souza V. Is sex in E. coli really necessary: experiments  and future research. Zoology Depatment seminar,  Universidad de Texas en Austin, septiembre 1994.

 

1995

2.-Souza V. Session leader and introduction to the clonality and recombination in microbial populations. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1995.

 

1997

3.-Souza V, V. Bouchet, M. Rocha, D. Gordon, L. Eguiarte. Linkage desequilibrium and effective population size in natural populations of Escherichia coli from wild mammals. Sesión plenaria, II International Workshop on molecular epidemiology and  evolutionary genetics of pathogenic microorganisms. Montpellier, Francia. Mayo 1997.

 

1999

4.-Souza V. Do we know who is E. coli ¿ UCI, Irvine California  Seminario departamental Septiembre 1999.

 

2000

5.- Souza V. y L. E. Eguiarte ¿Sabemos quien es Escherichia coli? Un estudio de genética de poblaciones y evolución molecular. Invitada al simposio "Ecologia tropical para el siglo XXI" Caracas, Venezuela noviembre 2000.

 

2001

6.- Souza. V. Ecologia, y Evolución de la patogénesis en E. coli. como parte de los ciclos en Ciencia Genómica organizada por el Centro de Fijación de Nitrógeno, UNAM. 29 de enero 2001.

 

7.- V. Souza, M. Travisano, P. Turner and L. E. Eguiarte.  Is experimental evolution relevant? Wild populations of E. coli vs. long term experimental evolution studies. Nith International Symposium on Microbial Ecology. Amsterdam, 26 al 31 de agosto 2001.

 

 

7.10. Trabajos en revisión:

1.- Rocha M., A. Cravioto, A. Navarro and V. Souza. The presence of the genes per and eaF as possible candidates for epidemiological survey of EPEC strains: a study of Escherichia coli  from wild mammals en revision para ser enviado a Emerging diseases.

 

2. V. Souza, M. Travisano, P. Turner and L. E. Eguiarte Does experimental evolution reflect patterns in natural populations? Comparison of E. coli strains from long-term studies to those from wild isolates. para ser enviado a Antoine van Leeuwenhoek

 

3. V. Souza, V. Bouchet, M. Rocha and L. E. Eguiarte  Linkage disequilibrium and effective population size in natural populations of Escherichia coli from wild mammals. Para ser enviado a Molecular Ecology.

 

 

7.11 Trabajos en preparación

 

1. C. Silva,V. Souza, A. Valera, V. Bouchet, and L. E. Eguiarte The temporal and spatial genetic structure of Rhizobium etli bv phaseoli in two contrasting agricultural systems.

 

2. V. Souza R. Ceritos, and L. E. Eguiarte. Hierarchical genetic structure of natural populations of Escherichia coli in Mexican bats.

 

3. C. Silva, L. E. Eguiarte and V. Souza. Plasmidic and Chromosomal dynamics of a Rhizobium etli local population.

 

 

 

8.-Formación de recursos humanos

 

8.1 Tesis dirigidas

a) Tesis concluidas

1) Nivel licenciatura,

1) Martha Rocha Munive. Bióloga. "Estructura genética de poblaciones naturales de Escherichia coli en mamíferos silvestres". Facultad de Ciencias. Abril, 1996.

 

2) Valérie Béatrice Bouchet López. Bióloga. “ Estructura genética de Rhizobium etli, durante un ciclo de siembra (1994), en Calpan, Puebla.”. Mención honorífica, Facultad de Ciencias. Enero, 1997.

 

3) Aldo Valera Vázquez “Influencia de las actividades agrìcolas sobre la estructura genètica de Rhizobium etli en simbiosis con Phaseolus vulgaris y P. coccineus”. Facultad de Biología de la Universidad Autónoma de Michoacán,Agosto, 1997.

 

4) Renè Cerritos Flores. “anàlisis jeràrquico en la estructura genètica de Escherichia coli asociada a murcièlagos de la repùblica Mèxicana. Facultad de Ciencias.Enero, 1998.

 

2) Nivel Maestría

1)Claudia Verònica Silva Romero. "Estructura genética de Rhizobium etli en San Miguel Acuexcomac, Puebla, Mexico". Maestria en Ciencias (Ecología y Ciencias ambientales) Facultad de Ciencias Septiembre 1998.

 

2)Marta Graciela Rocha Murive. "Plásmidos en y su importancia Escherichia coli en la evolución de la patogénesis" Maestría de la Facultad de Ciencias (Ecología y Ciencias ambientales) UNAM, Febrero 1999.

 

b) Tesis dirigidas en proceso

1)Nivel licenciatura

1) Antonio Cruz Estudiante de licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM, soy su directora de tesis, ingreso en enero 1998.

 

2)Nivel Maestría

2) Luisa Sandner. Estudiante de maestria de la Facultad de Ciencias (Ecología), UNAM, soy su directora de tesis de maestria.Fecha probable de recibirse marzo 2001.

3)

 

3) Nivel Doctorado

4) Claudia Silva. Estudiante de Doctorado en Ciencias Biomèdicas desde enero 1998.

5) Amanda Castillo. Estudiante de Doctorado en Ciencias Biomèdicas desde enero 2001.

 

 

8.3 Comites tutoriales y jurados de examenes profesionales

Maestría

1) Ariel Gonzales. Tesis de Maestria  “Dinámica de poblaciones en un periodo de aclimatación a compuestos fenólicos en lodos activados” Jurado para examen de maestría 21 de noviembre 1996..

 

2) Gloria Solís Guzmán. Estudiante de maestría, Facultad de Ciencias UNAM, Soy miembro de su comite tutorial desde septiembre 1996.

 

3) Arturo Becerra Bracho Tesis de maestria Evolución molecular de las rutas de salvamento de nucleótidos de purinas. Jurado para examen en marzo, 1997

 

4) Ana Cecilia Mesa. Caracterización de aislados clínicos y de la naturaleza de Sporothrix schenckii. Jurado para examen octubre, 2000.

 

Doctorado

5) José Adelfo Escalante Lozada. Candidato a doctorado en Biotecnología, Soy miembro de su comité desde septiembre 1994.

 

6) Patricia Colunga. Tesis doctoral “Origen Variación y Tendencias Evolutivas del Henequen (Agave fourcryodes). Jurado de examen doctoral,  6 diciembre 1996.

 

7) Irma J. Sanchez Vargas Tesis Doctoral “analisis de la heterogeneidad genómica del virus del dengue y su relación con la expresion de neurovirulencia. Jurado de examen doctoral 26 noviembre 1996.

 

8) Arturo Becerra Bracho Tesis de doctorado. El papel de la duplicación génica en la evolución temprana de la vida. Jurado para examen en noviembre 2000.

 

9)Pablo Maravilla. candidato de doctorado. Soy miembro de su comité desde septiembre 1996.

 

10)Luis Delaye Arredondo. Candidato de doctorado. Soy miembro de su comité desde septiembre 1998.

 

 

9. Idiomas.

100% Francés, Inglés y Español.

 

Asesorias, Entrenamiento de Estudiantes y colaboración con otras Instituciones

a)Estancias

1) José García Franco. Estudiante de Doctorado de la Facultad de Ciencias. Elaboración de electroforesis en acetato de celulosa de Bdallophytum bambusorum. Asesoria técnica y análisis de datos. De marzo 1994 a agosto 1994

 

2) Aldo Valera Vázquez. Estudiante de biología de la Universidad Autónoma de Michoacán. Estancia aprendiendo técnicas microbiológicas, genética de poblaciones y de biología molecular. Su estancia en el laboratorio fue de agosto y septiembre 1994.

 

3) Rocio Montes. Estudiante de preparatoria del Colegio Madrid. Forma parte del programa "Jovenes hacia la investigación científica". Estancia de todo el verano 1994 aprendiendo técnicas microbiologícas, de biología molecular y genética de poblaciones.

 

4) Yadira Olvera Carrillo. Estudiante de la escuela nacional preparatoria 8. Forma parte del programa "Jovenes hacia la investigación científica". Estancia de todo el verano 1996 aprendiendo técnicas microbiologícas, de biología molecular y genética de poblaciones.

 

5) Carlos Lozano Flores. Estudiante de la escuela nacional preparatoria 1. Forma parte del programa "Jovenes hacia la investigación científica". Estancia de todo el verano 1996 aprendiendo técnicas microbiologícas, de biología molecular y genética de poblaciones.

 

6) Gloria Luz Godínez Rivas. Estudiante de la escuela nacional  preparatoria 2. Forma parte del programa "Jovenes hacia la investigación científica". Estancia de todo el verano 1996 aprendiendo técnicas microbiologícas, de biología molecular y genética de poblaciones.

 

7) Rodolfo Blanco Rojas. Estudiante de la escuela nacional preparatoria 8 Forma parte del programa "Jovenes hacia la investigación científica". Estancia de todo el verano 1996 aprendiendo técnicas microbiologícas, de biología molecular y genética de poblaciones.

 

8) Estrella Mociño Deloya. Estudiante de la escuela nacional preparatoria 4. Forma parte del programa "Jovenes hacia la investigación científica". Estancia de todo el verano 1996  aprendiendo técnicas microbiologícas, de biología molecular y genética de poblaciones.